2017年

2017年3月1日，青岛能源所“沼气高效提纯精制生物天然气技术”项目获得2016年度青岛市科技进步奖三等奖（第一单位）。

2017年3月2日，青岛能源所与大连化物所融合发展，建立一套班子，第三届领导班子成立，刘中民任所长；彭辉、吕雪峰、金玉奇、蔡睿任副所长；免去许辉副所长职务。【领导班子个别调整：2021年2月7日，免去金玉奇副所长职务。2021年5月8日，李先锋、王峰任副所长。】

2017年8月2日，青岛能源所成立第四届学术委员会，徐健任主任，咸漠、崔光磊任副主任。

2017年9月1日，依托青岛能源所建设的“山东省能源生物遗传资源重点实验室”被评为优秀（1/10）。

2017年9月13日，青岛能源所获批建设“青岛市碳数据与碳评估工程实验室”。

2017年9月21日，青岛能源所与莱西市政府共建的青岛能源所城镇化发展研究中心暨莱西市产业技术研究院正式成立，并召开了第一届第一次理事会。

2017年10月9日，《中国科学院关于批准筹建深海技术等6个创新研究院的通知》（科发函字〔2017〕446号）批准依托大连化学物理研究所，青岛能源所等单位参与，筹建中国科学院洁净能源创新研究院。

2017年10月27日，青岛能源所第一届学风道德委员会成立，张玉奎为主任；冯埃生、李盛英为副主任。

2017年11月30日，青岛能源所获批建设合成生物技术创新中心，该中心是山东省首个由科研院所牵头组建的技术创新中心。

2018年

2018年3月6日，青岛能源所“清源聚能”文化论坛正式启动，中国科学院原副院长杨柏龄受邀出席并作首场报告。

2018年3月23日，依托青岛能源所建设的“山东省沼气工业化生产与利用工程实验室”获评优秀。

2018年3月23日，青岛能源所“光驱固碳产能蓝细菌的人工设计与构建”项目获得2017年度山东省自然科学奖二等奖（第一单位）。

2018年4月1日，青岛能源所“新能源电池关键材料体系的应用基础研究”项目获得2017年度青岛市自然科学奖一等奖（第一单位）；“木材产量和材性的调控机制”项目获得2017年度青岛市自然科学奖二等奖（第一单位）。

2018年6月5日，中国科学院副院长、党组成员相里斌一行调研青岛能源所。

2018年6月29日，青岛能源所举行2018届研究生毕业典礼。

2018年7月27日，依托青岛能源所建设的山东省合成生物技术创新中心获批成立。

2018年10月23日，山东省发展和改革委员会调研青岛能源所，提出在中国科学院洁净能源创新研究院（青岛）基础上，由中国科学院、山东省政府、青岛市政府三方共建山东省能源研究院建设构想。

2018年12月17日，依托青岛能源所建设的山东省含能材料生物合成工程技术研究中心获批成立。

2019年

2019年2月22日，青岛能源所“新能源电池若干问题的应用基础研究”项目获得2018年度山东省自然科学奖一等奖（第一单位）。

2019年4月8日，中国科学院、山东省政府共同签署《山东省人民政府 中国科学院推进山东新旧动能转换重大工程合作协议》，依托青岛能源所，在中国科学院洁净能源创新研究院（青岛）基础上筹建山东能源研究院。

2019年4月15日，依托青岛能源所建设的山东省单细胞油脂工程实验室获批成立。

2019年6月17日，中国科学院、山东省政府、青岛市政府共同签署《山东能源研究院共建协议》，山东能源研究院建设正式启动。

2019年6月28日，青岛能源所举行2019届研究生毕业典礼。

2019年10月11日，《山东能源研究院建设方案》通过2019年第11次中国科学院院长办公会审议。

2019年12月6日，青岛能源所（山东能源研究院）在日本东京举办首届中-日新能源车用动力电池论坛暨“电动汽车动力系统合作联盟”揭牌仪式，山东省省委书记刘家义，山东省委常委、秘书长孙立成，日本科学技术振兴机构（JST）常务理事甲田彰，JST中国研究﹒樱花科技中心（CRSC）主任有马朗人，首席研究员冲村宪树出席了揭牌仪式。

2019年12月22日，青岛能源所获得知识产权管理体系认证证书，认证范围覆盖生物能源（含生物制品）、生物基材料、能源应用技术领域。

2020年

2020年1月2日，依托青岛能源所建设的山东能源研究院第一届领导班子成立，刘中民任院长，彭辉、吕雪峰、金玉奇、蔡睿任副院长。【领导班子个别调整：2021年2月7日，徐峰任副院长，免去金玉奇副院长职务。2022年8月4日，吕雪峰任院长，吴绪永任副院长，免去刘中民院长职务，免去蔡睿副院长职务。】

2020年1月3日，依托青岛能源所建设的山东能源研究院完成法人注册登记，获得省级事业单位法人证书。

2020年1月9日，中国科学院与山东省人民政府在济南召开山东能源研究院成立座谈会。

2020年1月9日，山东能源研究院建设领导小组召开第一次会议。

2020年5月28日，青岛能源所第三届党委领导班子成立，彭辉任党委书记，冯埃生任党委副书记，许辉任党委副书记，吕雪峰、陈骁、崔光磊任委员。青岛能源所第三届纪委领导班子成立，冯埃生任纪委书记，南庆平任纪委副书记，官杰、张海波、汪辉任委员。【领导班子个别调整：2020年11月4日，免去冯埃生党委副书记、纪委书记职务。2021年2月7日，李明任纪委书记，徐峰任党委副书记。2025年1月3日，吕雪峰任党委书记，孙军任纪委书记；免去彭辉党委书记、副所长职务，免去李明纪委书记职务。】

2020年7月2日，青岛能源所获批材料与化工工程博士专业学位授权点，成为国科大首批获得该专业领域工程博士培养点的培养单位之一。

2020年7月3日，青岛能源所举行2020届研究生毕业典礼。

2020年8月6日，山东省委书记刘家义调研青岛能源所。

2020年8月24日，青岛市发改委批复山东能源研究院一期基础设施工程（青岛能源所王哥庄园区）项目立项。

2020年9月7日，中共山东省委机构编制委员会办公室备案批准山东能源研究院500个人员控制总量。

2020年10月19日，青岛能源所通过质量管理体系认证，认证范围覆盖生物基含能材料的研发与试制。

2021年10月28日，青岛能源所获得CNAS资质（注册号CNAS L13762）。

2020年11月9日，山东省人力资源和社会保障厅同意山东能源研究院自主实施人员招聘、岗位评聘、工资薪酬管理，明确研究院工作人员纳入事业单位保险体系。

 2020年11月11日，山东能源研究院建设工作推进组第二次会议在青岛召开，会议审议通过研究院章程与基建规划，明确研究院顶层设计、成果转化、人才引育三大核心发展方向。同日，青岛能源所王哥庄园区举行奠基仪式，正式开工建设。

2020年12月5日，青岛新能源山东省实验室组建方案通过专家论证会。

2020年12月17日，山东能源研究院国际学术咨询委员会成立并召开第一次会议，谢克昌（中国工程院院士，中国工程院原副院长）任主任，欧阳明高（中国科学院院士，清华大学教授）任副主任。

2020年12月17日，依托青岛能源所建设的青岛新能源山东省实验室举行挂牌仪式。

2021年

2021年3月26日，中国科学院撤销依托青岛能源所建设的院级非法人单元中国科学院青岛产业技术创新与育成中心。

2021年6月1日，青岛能源所“口腔菌群诊断和预测龋病的致病机制研究及其应用”项目获得2020年度青岛市科技进步奖二等奖（第一单位）。

2021年6月25日，青岛能源所举行2021届研究生毕业典礼。

2021年7月5日，依托青岛能源所建设的青岛新能源山东省实验室建设方案获山东省人民政府正式批复（鲁政字〔2021〕119号）。

2021年9月29日，依托青岛能源所建设的山东能源研究院建设工作推进组召开第三次会议，审议通过《山东能源研究院省级建设发展资金管理办法》及年度资金使用计划。

2021年10月10日，中国科学院副院长、党组副书记阴和俊调研青岛能源所。

2021年12月21日，青岛能源所“生物质多糖降解酶功能和催化机制研究”项目获得2021年度山东省自然科学奖二等奖（第一单位）；“生物高分子低维纳米复合与仿生设计”项目获得2021年度山东省自然科学奖二等奖（第一单位）。